哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院前身为创建于1981年的医用高等数学教研室，2004年建立生物信息学系，2006年建立生物信息科学与技术学院，2009年相继成为黑龙江省一级重点学科、省领军人才梯队、省创新教学团队、省研究生导师创新团队，创建了黑龙江省重大疾病组学生物信息重点实验室、黑龙江省生物信息学学会。学院现有教职员工70余人，其中教授13人，副教授39人，我国著名生物信息学家、龙江学者李霞教授任院长、肖云教授、徐娟教授任副院长。李霞教授带领学院科研团队、"头雁"团队，引领我省重大疾病组学大数据创新研究，实现学院科研创新团队新突破。近年来学科建设快速稳定发展，尤其在重大疾病的生物信息学与计算系统生物学研发和人才培养方面独具特色，生物信息学领域科学研究实力处于国内前列，教育教学水平居于国家领军地位。
生物信息科学与技术学院是国内最早招收生物信息学、生物医学软件工程和药物基因组信息学专业博士、硕士研究生和本科生的单位之一，主持建立的生物信息学教育教学体系已成为全国生物信息学教学模板，人才培养质量和数量均居国内首位。学院（系）自2001年起招收博士、硕士研究生，2003年招收本科学生，已毕业博士、硕士研究生500余人，本科生1500余人，连续15年一次就业率95％以上，为国内外生物医学研究和生物医药产业输送了大批优秀人才。目前在读学生近千人（博士生25人，硕士生191人，本科学生722人），形成学院发展坚实的后备力量。
哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院下设10个教研室一代表了生物信息学、生物医学工程、药物基因组信息学、系统生物学、计算生物学、表观遗传学、统计遗传学、生物物理学和生物数学等多个方向和研究领域，及生物医学木数据研究中心、生物信息大学生创新基地、黑龙江省重大疾病组学生物信息重点实验室、黑龙江省生物信息学学会。学科门类齐全、研究方向和硬件设施完备，已经形成国内领先水平和最大规模的生物医学工程（生物信息学）专业人才团体，为国家生物医药高新技术发展和紧缺人才培养做出杰出贡献。
