代谢性疾病（Metabolic Diseases, MDs）是全球重大公共健康负担，其发生发展并非由单一代谢通路异常驱动，而是多个代谢过程、细胞类型与微环境信号共同重塑的结果。然而，现有研究多聚焦于孤立通路或单一疾病，难以系统解析不同代谢性疾病之间共享与特异的代谢调控规律。为突破这一局限，哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院张云鹏教授团队系统整合公开单细胞RNA测序数据，构建了覆盖七类主要代谢性疾病的单细胞代谢图谱，并...
免疫治疗，尤其是免疫检查点抑制剂（immune checkpoint inhibitors, ICIs）的广泛应用，显著改善了多种肿瘤患者的临床预后，但患者间普遍存在的治疗响应的异质性，限制了其临床获益范围。近年来，随着高通量测序技术的快速发展和人工智能方法在生物医学领域的广泛应用，大规模基因组数据为免疫治疗响应预测提供了新的机遇。然而，如何有效整合复杂的基因组变异信息与生物学通路网络拓扑知识，从而提高免疫治疗响应预测的准确性...
癌细胞中存在合成致死（Synthetic Lethality, SL）与合成存活（Synthetic Viability, SV）两类遗传互作效应。SL指两个基因同时改变可导致细胞死亡，SV则能挽救单个基因改变带来的致死效应。SL已被视为探索癌症治疗靶点和药物敏感性标志物的重要途径，而SV则与癌细胞耐药性密切相关。当前识别遗传互作的方法主要依赖Bulk转录组数据，掩盖了肿瘤微环境中不同细胞的特异性效应。如何在单细胞分辨率下系统解析遗传互作效应并用于癌...
孟德尔遗传定律中的“独立分配定律”告诉我们：位于不同染色体上的基因在减数分裂过程中形成配子时随机组合、互不干扰。但由于百万亿次的超大计算量的阻碍，这一现象从未在全基因组尺度上被严格验证。近日，生物信息科学与技术学院姜永帅教授团队在生物学权威期刊《GenomeBiology》上发表了题为“GPU-accelerated linkage disequilibrium scans reveal non-independent assortment of human non-homologous chromosomes”的研究...
