智慧，教授，博士生导师。
邮箱：zhihui@ems.hrbmu.edu.cn
主要研究方向
生物信息学，人工智能和机器学习。开发识别DNA甲基化异质性特征算法及工具入手，开发cfDNA甲基化测序数据模拟工具。针对单细胞及组织水平的DNA甲基化测序数据特点开发DNA甲基化异质性定量算法和计算模型。利用DNA甲基化异质性解析肿瘤异质性及新型生物标志物。特异性地解析DNA甲基化异质性是否能够在不同癌症亚型之间提供有效的区分，分析其在肿瘤生物学中的功能，并进一步解析其在促进肿瘤的发生、发展和演进的表观调控机制。开发以细胞类型特异的表观遗传异质性为特征的肿瘤诊断及预测算法以及基于单细胞DNA甲基化异质性数据的数据库及在线工具。
个人简介
智慧，女，生物物理学博士，教授，博士生导师。自2008年起从事生物信息学领域的教学和研究工作。发表高水平SCI科研论文。主要研究方向为人类复杂疾病相关长非编码RNA识别、功能及相关表观遗传调控机制研究，非编码RNA相关生物网络的构建及生物信息学平台及软件开发等。近期研究论文发表在《Nucleic Acid Research》、《Briefings in bioinformatics》、《Oncogene》等杂志上。研究并开发的癌症相关lncRNAs甲基化调控模式查询计算平台lnc2Meth已被国内及国际众多研究机构和科研人员使用。承担《基因组信息学》、《生物信息学进展》、《功能基因组学》、《Linux操作系统与shell编程》、《生物信息学专业英语》、《新一代测序数据分析》等课程的本科生、硕士研究生及留学生教学工作。参与编写国家十二五规划教材《生物信息学》（一、二版）、《生物信息学理论与医学实践》、《Non-coding RNAs in Complex Diseases》等教材和书籍。主持并参与国家自然科学基金面上、青年项目及省厅级项目的研究工作。
学术兼职
1、中国自动化学会智能健康与生物信息专业委员会委员
2、中国生物信息学学会（筹）生物数据资源专业委员会委员
3、中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会委员
教育经历
2001-2005同济大学本科应用化学
2005-2008同济大学硕士研究生分析化学
2011-2014哈尔滨医科大学 博士研究生 生物物理（生物信息学方向）
工作经历
2008-至今 哈尔滨医科大学 生物信息科学与技术学院 教师
编写书籍
《生物信息学（第二版）》，人民卫生出版社，ISBN-13 : 978-7117204538，ISBN-10 : 7117204532，参编
《生物信息学（第一版）》，人民卫生出版社，参编
《生物信息学理论与医学实践》，人民卫生出版社，参编
《Non-coding RNAs in Complex Diseases》，Springer，参编
《精准医学与分子组学大数据》，在编
主持项目
《增强子参与遗传及表观遗传调控模式研究（32170674）》，国家自然科学基金面上项目，主持
《基于DNA甲基化-lncRNAs调控网络系统识别恶性肿瘤风险lncRNAs及其表观遗传调控机制研究（31501038）》，国家自然科学基金青年项目，主持
《利用最大似然模型识别泛癌中增强子介导的DNA甲基化调控模式（LH2020C056）》，黑龙江省自然科学基金联合引导项目，主持
《长非编码RNA参与恶性肿瘤特异的表观遗传调控机制研究（2016M546）》，中国博士后科学基金面上项目，主持
《基于整合基因组学方法研究恶性肿瘤中长链非编码RNA表观遗传调控模式及肿瘤生物标志物发现（LBH-Z15132）》，黑龙江省博士后项目，主持
《恶性肿瘤中增强子参与的表观遗传调控模式研究》，黑龙江省博士后启动项目，主持
指导学生
2019年度全国大学生统计建模大赛，二等奖，指导教师。
获奖情况
2024年黑龙江省医药卫生科学技术奖一等奖
2020中华医学会,科技进步奖，《恶行肿瘤风险非编码RNA的调控机制研究及大数据平台应用》，第五位
2020年哈尔滨医科大学英语风采授课大赛二等奖
2017年哈尔滨医科大学优秀科技工作者
代表文章
1 A novel reannotation strategy for dissecting DNA methylation patterns of human long intergenic non-coding RNAs in cancers [J]. Nucleic Acids Res, 2014, 42(13): 8258-70. SCI影响因子：16.971第一作者
2 Lnc2Meth: a manually curated database of regulatory relationships between long non-coding RNAs and DNA methylation associated with human disease [J]. Nucleic Acids Res, 2018, 46(D1): D133-D8. SCI影响因子：16.971第一作者
3 MSDD: a manually curated database of experimentally supported associations among miRNAs, SNPs and human diseases [J]. Nucleic Acids Res, 2018, 46(D1): D181-D5. SCI影响因子：16.971并列一作
4 Comprehensive characterization genetic regulation and chromatin landscape of enhancer-associated long non-coding RNAs and their implication in human cancer. Brief Bioinform, 2021 Sep 28;bbab401. doi: 10.1093/bib/bbab401 SCI影响因子：11.622通讯作者
5 Inferring SARS-CoV-2 functional genomics from viral transcriptome with identification of potential antiviral drugs and therapeutic targets. Cell Biosci. 2021 Sep 8;11(1):171. doi: 10.1186/s13578-021-00684-4 SCI影响因子：7.133通讯作者
近期研究工作
1.DNA methylation heterogeneity attributable to a complex tumor immune microenvironment prompts prognostic risk in glioma, Epigenetics, 2024, 19(1)通讯作者
2.A Computational Strategy for Drug Repositioning Based on Support-Vector Regression Algorithm, INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES, 2024, 25(10)通讯作者
3.Enhancer methylation dynamics drive core transcriptional regulatory circuitry in pan-cancer, Oncogene, 2022, 41(26): 3474-3484通讯作者
4.Epigenome signature as an immunophenotype indicator prompts durable clinical immunotherapy benefits in lung adenocarcinoma, Briefings in Bioinformatics，Volume 23, Issue 1, January 2022, bbab481通讯作者
