邵婷婷，教授,博士研究生导师，星联教师，哈医大生物信息科学与技术学院表观遗传学教研室教师。
办公地址：分子生物211
E-mail：shaotingting@hrbmu.edu.cn
主要研究方向
生物信息学；生物信息学、肿瘤免疫信息学、智能医学工程
个人简介
邵婷婷，教授,博士生导师，星联教师
研究方向为生物信息学，主要研究肿瘤免疫、细胞通讯以及大语言模型开发。先后主持国家自然科学基金面上项目等共计8项，包括等；近年来以第一作者及通讯作者在《American Journal Of Human Genetics》《Nucleic Acids Research》及《Molecular Cancer》等高水平杂志发表多篇SCI论文，参与编写springer出版社《Functional Genomics》等2部外文论著，担任中国抗癌协会肿瘤标志专业委员会-肿瘤测序及大数据分析专家委员会委员，黑龙江省生物信息学学会理事，国家自然科学基金通讯评审专家及Scientific Reports、BMC genomics等杂志审稿人。获得中华医学会科技奖三等奖1项，参编国家规划教材《生物信息学学习指导及习题集》1部。获得黑龙江省高校教师教学创新大赛三等奖1项及院二等奖1项。辅助指导及指导7届本科生毕业设计共计25人，获得优秀毕业论文4人。获得省教学成果一等奖1项，二等奖1项，校级教学成果一等奖2项，二等奖1项，主持省教学改革项目1项，校思政课程建设项目1项，先后指导省大学生创新创业训练项目1项及校级创新项目1项，指导大学生建模竞赛获得亚太国际建模比赛三等奖，大学生数学建模竞赛国家级二等奖等，省级一等奖,及省级二等奖等多个奖项。
教育经历：
1.2010/09-2015/06，哈尔滨医科大学，生物信息科学与技术学院，博士，导师：李霞
2.2005/09-2010/06， 哈尔滨医科大学，生物信息科学与技术学院，学士
工作经历：
1. 2022/09-至今，哈尔滨医科大学，生物信息科学与技术学院，教授
2. 2017/08-2022/8，哈尔滨医科大学，生物信息科学与技术学院，副教授
3. 2016/01-2019/10，哈尔滨医科大学，基础医学院，博士后，合作导师：金焰
4. 2015/07-2017/07，哈尔滨医科大学，生物信息科学与技术学院，讲师
获得的奖励和荣誉：
1.中华医学会科技奖三等奖，2024，排名第三
2.黑龙江省高校教师创新大赛产教融合赛道三等奖，2024，排名第一
3.黑龙江省教学成果一等奖：十年磨一剑，开创生物医药数据科学人才培养先河的探索与实践，2024，排名第五
4.黑龙江省教学成果二等奖：科教融合全程多元知行合一的生物信息学专业创新教学体系研究与实践，2022，排名第四
5.哈尔滨医科大学教学成果一等奖：“科教融合、全程多元、知行合一”的生物信息学专业创新教学体系研究与实践，2022，排名第四
6.哈尔滨医科大学教学成果二等奖：生物信息学专业教育混合创新教学模式的研究，2020，排名第二
7.哈尔滨医科大学教学成果一等奖：新建-新兴-新型：生物医药数据科学创新型人才培养模式的构建与实践，2024，排名第五
8.哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院青年教师讲课大赛二等奖，2016年
指导学生获奖及创新创业项目：
1.国际三等奖（指导教师），2021年，亚太国际建模比赛
2.国家二等奖（指导教师），2020年，中国数学建模竞赛；
3.省一等奖（指导教师），2020年，中国数学建模竞赛
4.省一等奖（指导教师），2019年，中国数学建模竞赛
5.省一等奖（指导教师），2020年，东三省数学建模竞赛
6.省一等奖（指导教师），2019年，东三省数学建模竞赛；
7.省三等奖（指导教师），2019年，东三省数学建模竞赛；
8.黑龙江省创新创业项目（指导教师），2016年，黑龙江省教育厅；
9.哈尔滨医科大学优秀本科生论文指导教师，2021年，哈尔滨医科大学；
参编著作:
1.《Computational epigenetics for breast cancer》，2019年，Elsevier出版社，编委
2.《Functional Genomics》（the third edition），2017年，springer出版社，编委
科研项目：
1.国家自然科学基金面上项目，肿瘤免疫微环境中非编码RNA协同调控网络构建及调控机制研究，2021/01-2024/12，结题，主持
2.国家自然科学基金青年项目，基于多组学数据融合的泛癌中非编码RNA crosstalk模式研究，2017/01-2019/12，结题，主持
3.黑龙江省自然科学基金联合引导项目，肿瘤免疫微环境中ncRNA共调控识别及其机制研究，2020/07-2023/07，结题，主持
4.黑龙江省自然科学基金联合引导项目，基于多维度细胞互作刻画方法探索肿瘤微环境中复杂通讯机制研究，2024/12-2027/12，在研，主持
5.黑龙江省博士后启动金项目，泛癌非编码RNA免疫协同调控网络构建及其临床应用研究，2021/01-2023/12,在研，主持
6.中国博士后基金面上项目，癌症中ncRNA交互作用系统识别及其功能特征研究，2017/05-2019/05，结题，主持
7．黑龙江省博士后基金项目，非编码RNA（miRNA/lncRNA）协同调控网络重构揭示癌症发生的共性及异质性研究,2016/12-2018/12，结题，主持
8．哈尔滨医科大学创新科学研究项目，基于ncRNA交互网络重构的癌症相关ncRNA优化及调控机制研究，2016/06-2017/12，结题，主持
9．黑龙江省硕士研究生创新基金一般项目，系统分析病毒miRNA宿主靶基因性质和virus-host交互模式，2012/05-2013/7，结题，主持
教学项目（仅列省部级）：
1.黑龙江省高等教育教学改革研究项目：基于智慧教学+CDIO理念的大学生数学建模培训实践与研究2020.3.30 ---2022.12.30经费：1万元，结题，主持
2.黑龙江省高教学会“十三五”规划课题：多学科交叉融合的生物信息学本科专业创新教学体系研究与实践，2018年，黑龙江省教育厅，结题，参与
3.黑龙江省研究生精品课程建设项目《肿瘤免疫信息学》：黑龙江省教育厅，在研，参与
4.黑龙江省研究生精品课程思政案例项目《肿瘤免疫信息学》：黑龙江省教育厅，在研，参与
学术兼职：
1.中国抗癌协会肿瘤标志专业委员会-肿瘤测序及大数据分析专家委员会委员；
2.黑龙江省生物信息学学会理事。
已发表论文（*为通讯作者，#为第一作者）：
1. Changbo Yang1,#, Yujie Liu2,#, Xiaohua Wang3,#, Qing Jia1,#, Yuqi Fan1, Zhenglin Lu1, Jingyi Shi 1,Zhaoxin Liu1, Gengdong Chen1, Jianing Li1, Weijian Lu1, Weiwei Zhou 1, Dezhong Lv1,Haozhe Zou1, Juan Xu 1, Yongsheng Li 2, Qinghua Jiang2,*, Tao Wang 4,* andTingting Shao1,*stSNV: a comprehensive resource of SNVs in spatial transcriptome,Nucleic Acids Research,2024.
2. Changbo Yang,1,# Yujie Liu,1,# Chongwen Lv,1,# Mengjia Xu,1,3 Kang Xu,1 Jingyi Shi,1 Tingting Tan,1Weiwei Zhou,1 Dezhong Lv,1 Yongsheng Li,2 Juan Xu,1,* andTingting Shao1,*CanCellVar: A database for single-cell variants map in human cancer,The American Journal of Human Genetics,2024.
3. Tingting Shao,1,#Jianing Li,1,#Minghai Su,1,#Changbo Yang,1 Yingying Ma,1 Chongwen Lv,1 Wei Wang,4Yunjin Xie,1 Gang Xu,1 Ce Shi,3 Xinying Zhou,3 Huitao Fan,3,* Yongsheng Li,2,* and Juan Xu1,6,*A machine learning model identifies M3-like subtype in AML based on PML/RARa targets,iScience,2024.
4. Yunjin Xie # , Weiwei Zhou # , Jingyi Shi # , Mengjia Xu , Zijing Lin , Donghao Li , Jianing Li , Shujun Cheng*,Tingting Shao*, Juan Xu*. A global database for modeling tumor-immune cell communication.Scientific Data,2023.
5. Yanan Jiang a,b,c,1, Jianing Li a,1, Yujie Liu a,1, Xiuyun Shen b, Junyi Li a, Fengnan Zhi b, Juan Xu a, Xia Li * a,2,Tingting Shao *a,2, Yingqi Xu *,Open a new epoch of arsenic trioxide investigation: ATOdb；Computers in Biology and Medicine2023.
6. Tingting Shao# , Yunjin Xie # , Jingyi Shi # , Changbo Yang , Haozhe Zou , Yongsheng Li , Juan Xu , Xia Li.Surveying lncRNA-lncRNA cooperations reveals dominant effect on tumor immunity cross cancers[J].Communications biology, 2022.
7. Dezhong Lv , Kang Xu , Changbo Yang , Yujie Liu 1, Ya Luo , Weiwei Zhou , Haozhe Zou , Yangyang Cai , Na Ding 1, Xia Li* ,Tingting Shao* , Yongsheng Li *, Juan Xu* .PRES: a webserver for decoding the functional perturbations of RNA editing sites[J].Briefings in Bioinformatics, 2022.
8. Xu Juan#*;Shao Tingting#; Song Mingxu#; Xie Yunjin; Zhou Jialiang; Yin Jiaqi; Ding Na; Zou Haozhe; Li Yongsheng*; Zhang Jiwei*; MIR22HG acts as a tumor suppressor via TGFβ/SMAD signaling and facilitates immunotherapy in colorectal cancer,Molecular Cancer, 2020, 19(51 (2020)).
9. Shi Yuchen#; Liu Hui#; Yang Changbo#; Xu Kang#; Cai yangyang; Wang Zhao; Zhao Zheng*;Shao Tingting*; Li Yixue*; Transcriptomic Analyses for Identification and Prioritization of Genes Associated With Alzheimer’s Disease in Humans,Frontiers in Bioengineering and Biotechnology, 2020, 31(8).
10. Hong Chen1,#, Jun Xiao1,#,Tingting Shao1,#, Li Wang1,#, Jing Bai1, Xiaoyu Lin1, Na Ding1, Yinwei Qu1, Yi Tian1, Xiang Chen1, Hui Liu1,*, Hongyu Liu3,*, Juan Xu1,2,* and Xia Li1,2,*Landscape of enhancer-enhancer cooperative regulation during human cardiac commitment.Molecular Therapy - Nucleic Acids；2019.7
11. Hui Liu,† Tiantongfei Jiang,† Shuyuan Wang,† Xiang Chen, Xiaoyan Jin, Qi Wang, Xinhui Li, Jiaqi Yin,Tingting Shao*,Yongsheng Li ,* Juan Xu,* and Qiong Wu*, A Novel Approach to Identify Enhancer lincRNAs by Integrating Genome, Epigenome, and Regulatome,Frontiers in Bioengineering and Biotechnology,2019; 7: 427
12. Tingting Shao*, Guangjuan Wang*, Hong Chen*, Yunjin Xie*, Xiyun Jin, Jing Bai, Juan Xu, Xia Li, Jian Huang, Yan Jin and Yongsheng Li, Survey of miRNA-miRNA cooperative regulation principles across cancer types,Briefings in Bioinformatics, 2018
13. Tingting Shao#, Zheng Zhao, Aiwei Wu, Jing Bai, Yongsheng Li, Hong Chen, Chunjie Jiang, Yuan Wang, Shengli Li, Letian Wang, Fengmin Zhang*, Juan Xu* , Xia Li*.Functional dissection of virus-human crosstalk mediated by miRNAs based on the VmiReg database[J].Molecular Biosystems, 2015.
14. Tingting Shao#, Aiwei Wu , Juan Chen , Hong Chen , Jianping Lu , Jing Bai , Yongsheng Li*, Juan Xu*, Xia Li*.Identification of module biomarkers from the dysregulated ceRNA-ceRNA interaction network in lung adenocarcinoma[J].Molecular Biosystems, 2015.
15. Yongsheng Li#,Tingting Shao#, Chunjie Jiang#, Jing Bai, Zishan Wang, Jinwen Zhang, Lili Zhang, Zheng Zhao, Juan Xu* & Xia Li* .Construction and analysis of dynamic transcription factor regulatory networks in the progression of glioma[J].Scientific Reports, 2015, 5: 15953-15953.
