徐锦远,副教授,博士。
团队网站:http://biocc.hrbmu.edu.cn/xteam/index.html?member=xujinyuan
E-mail:xujinyuan@hrbmu.edu.cn
主要研究方向
生物医学大数据整合分析,利用深度学习和单细胞数据解析肿瘤演化过程中的细胞状态动态变化、克隆结构以及分子功能机制。
个人简介
博士,副教授,硕士生导师,2008年考入哈尔滨医科大学生物技术专业,2013年获得理学学士学位;其后继续攻读哈尔滨医科大学生物医学工程硕士学位,并于2015年获得硕博连读资格,进一步学习生物信息学知识,夯实科研能力,2018年获得医学博士学位,并于同年留校,继续从事科研与教学工作。
近五年,先后主持或参加科研项目5项,其中主持国家自然科学基金青年项目1项,参与国家自然科学基金项目4项。以第一作者或通讯作者身份于国际重要学术刊物,包括《Nucleic Nucleic Acids Research》、《EBioMedicine》、《Briefings in Bioinformatics》、《Molecular Oncology》、《Stem Cells》、《Genomics》等,发表SCI论文12篇,并合作发表SCI论文9篇。其中,JCR 1区文章7篇,SCI影响因子>10的文章4篇,>5的文章4篇,单篇最高他引500余次。
教育经历
1. 2015.09–2018.06,哈尔滨医科大学,生物医学工程,博士,导师:程书钧,李霞
2. 2013.09–2015.06,哈尔滨医科大学,生物医学工程,硕士,导师:李霞
3. 2008.09–2013.06,哈尔滨医科大学,生物技术, 学士
工作经历
2021.08-至今,哈尔滨医科大学,生物信息科学与技术学院,副教授
2018.07-2021.07,哈尔滨医科大学,生物信息科学与技术学院,讲师
2018-07-2020-07,哈尔滨医科大学附属第二医院,神经内科,博士后,导师:王丽华
主持科研项目
国家自然基金委员会——国家自然青年基金
《基于单细胞RNA-seq数据识别介导癌症hallmark活性的关键lncRNA及其功能研究》
2021.01-2023.12
指导学生获奖
2019年全国大学生数学建模竞赛全国二等奖
2022年美国大学生数学建模竞赛M奖(一等奖)
2023年东北三省数学建模联赛一等奖
2023年全国大学生数学建模竞赛黑龙江赛区一等奖
发表SCI论文
1)Identifying the personalized driver gene sets maximally contributing to abnormality of transcriptome phenotype in glioblastoma multiforme individuals; Molecular Oncology; 2023.11;Jinyuan Xu(第一作者); SCI收录;影响因子6.6
2)The Heterogeneous Cellular States of Glioblastoma Stem Cells Revealed by Single Cell Analysis; Stem Cells; 2023.03;Jinyuan Xu(通讯作者); SCI收录;影响因子5.85
3)Systematic investigation of the prognostic impact of clonal status of somatic mutations across multiple cancer types; Genomics; 2022.07;Jinyuan Xu(通讯作者); SCI收录;影响因子6.205
4)Capturing functional long non-coding RNAs through integrating large-scale causal relations from gene perturbation experiments;EBioMedicine;2018.09;Jinyuan Xu(1);SCI收录;影响因子11.205
5)CellMarker: a manually curated resource of cell markers in human and mouse;Nucleic Acids Research;2019.01;Jinyuan Xu(并列第一(3));SCI收录;影响因子16.971
6)Breast cancer prognosis signature: linking risk stratification to disease subtypes; Briefings in Bioinformatics;2019.11;Jinyuan Xu(并列第一(3));SCI收录;影响因子11.622
7)A comprehensive overview of lncRNA annotation resources;Briefings in Bioinformatics;2017.05;Jinyuan Xu(1);SCI收录;影响因子11.622
8)Integrated analysis of ferroptosis-related gene signature for overall survival prediction in Asian patients with hepatocellular carcinoma; Clinical & translational oncology; 2023.03;Jinyuan Xu(通讯作者); SCI收录;影响因子3.34
9)Identification of Dysregulated Competitive Endogenous RNA Networks Driven by Copy Number Variations in Malignant Gliomas; frontiers in Genetics; 2019.10;Jinyuan Xu(1);SCI收录;影响因子3.258
10)Identification of a Six-lncRNA Signature With Prognostic Value for Breast Cancer Patients; frontiers in Genetics; 2020.07;Jinyuan Xu(通讯作者);SCI收录;影响因子3.258
11)Genome-wide DNA methylome reveals the dysfunction of intronic microRNAs in major psychosis;BMC Medical Genomics;2020.07;Jinyuan Xu(并列第一(2));SCI收录;影响因子2.8714
12)Transcriptome analysis reveals a reprogramming energy metabolism-related signature to improve prognosis in colon cancer; PeerJ; 2020.07;Jinyuan Xu(并列第一(2));SCI收录;影响因子2.984