生物医学大数据中心

生物医学大数据中心简介

时间:2023-02-17 点击数:

哈尔滨医科大学生物医学大数据研究中心建于2014年10月,以“生物医学+”和“信息科学+”双引擎驱动学科发展战略,搭建生物医学信息学融合平台,“生物医学+信息”中心,该中心基于我校生物信息科学与技术学院在生物医学大数据交叉学科研究的优势,与哈尔滨医科大学的医学多学科合作;凭借哈尔滨医科大学四家附属医院的优质海量数据资源;以学科交叉的创新途径开展研究,争取在生物医学基础与理论、预防、诊断与治疗等方面实现体系创新、技术创新、模式创新,在新发展理念的指引下,坚持“创新、开放、协同、共赢”原则,与校外企事业单位及科研院所一起,共同实施转化研究,为实现健康中国战略、构建人类健康命运共同体贡献哈医大力量。

本中心主持和参加多项国家级项目和平台建设。中心目前已建成硬件平台拥有PB级存储的高性能计算平台,可支持多方向的医学大数据与人工智能科研工作。

◆中心主任:张云鹏,教授,博士生导师

◆中心副主任:宁尚伟,教授,博士生导师

◆中心副主任:徐英岐,副教授,硕士导师

◆中心副主任:白静,副教授,硕士导师

科学研究

研究方向

(一)建立复杂疾病精准医学数据资源

基于东北地区丰富的样本资源,提取基因数据信息,形成基础基因数据库以及针对特定功能的衍生数据库,实现各类疾病样本数据(系列多组学)存储、标准化、交叉融合等基本功能,为复杂疾病的防治奠定数据基础,为精准医学发展提供核心的技术服务和数据支撑。

复杂疾病大数据标准化体系与共享平台建设建立复杂疾病大数据平台的基础架构和技术体系;建设多维、动态多层次大数据汇交、管理、分析、共享和应用的技术平台;研发管理、注释、比较和展示TB到PB以上量级群体和个人基因组数据与临床信息的应用技术系统;开发面向复杂疾病的大数据搜索引擎和大型知识库系统。

(二)研发新一代精准医学信息技术

1.基于精准医学大数据,对个体或群体进行全面的监测、分析、评估,提供健康咨询和指导以及对健康危险因素进行干预的全过程,开发网络平台精准医学云服务。

2.整合多组学信息,研发面向重大疾病分子机制探索、临床管理和药物设计的新技术和新方法,为生物医学诊疗拓展新的思路和构想。

3.建立血液中关键生物标识物的识别,加速液体活检血液中游离的循环肿瘤细胞(CTCs)、循环肿瘤DNA(ctDNA)、循环RNA(CirculatingRNA)等检测技术的发展,使之能够快速临床应用,进而达到无创微创检测监控。

(三)临床精准诊疗信息决策方案的研发

1.建立大规模健康人群和特定疾病高发区前瞻性队列,识别环境暴露因素和个体内因调查和检测研究;

2.给出疾病早期诊风险预警和筛查,分子诊断、分型、预后、复发和转移标志物,药物靶标筛选和治疗敏感性监测解决方案,推动具有创新性和独立知识产权的诊断试剂盒等专利产品的面世,促进科研成果产业化和健康产业活跃创新,带动区域内经济发展;

3.结合分子影像学和病理学的精准诊断,临床分子分型,个人全面组学信息,针对患者个体差异,探索如造血干细胞移植,靶向治疗、免疫治疗和细胞治疗等新的个体化生物治疗方案,促进生物医学健康大数据知识提取,挖掘,并向临床诊疗和个体化用药转化。

人才培养

本中心定期举办精准医学国内国际会议和论坛,促进国际前沿和项目的交流与合作。开展专业化,规模化,系统化的大数据与精准医学人才培养、培训工作,推动精准医学高尖端人才培养和教育体制改革,为临床实践和健康产业提供核心的生物信息学人才贮备。

资源链接

本中心在著名生物信息学家李霞教授的带领下,围绕重大疾病的生物信息学与计算系统生物学领域研究独具特色,近年来致力于生物医学大数据、精准医学和大健康信息学等前沿交叉领域研究,科研水平处于国内院校前列,重大疾病的生物信息学与计算系统生物学研究独具特色,在复杂疾病的风险标志物识别、非编码RNA的功能与作用机制研究、疾病风险基因定位与通路重构、疾病表观遗传改变机制研究、药物靶标识别、新一代测序技术数据拼装与分析、基因芯片数据分析与算法开发,及分子生物学软件与平台开发等领域取得突出成就。

平台链接

http://bio-bigdata.hrbmu.edu.cn/Fun-CR

http://bio-bigdata.hrbmu.edu.cn/MutRIC

http://bio-bigdata.hrbmu.edu.cn/MutLncDR

http://bio-bigdata.hrbmu.edu.cn/LncMAP

http://bio-bigdata.hrbmu.edu.cn/SERT

http://bio-bigdata.hrbmu.edu.cn/Lnc2Meth

http://bio-bigdata.hrbmu.edu.cn/lncrnaontology2

http://bio-bigdata.hrbmu.edu.cn/msdd

http://bio-bigdata.hrbmu.edu.cn/dras_net

http://bio-bigdata.hrbmu.edu.cn/CARDIO-LNCRNAS

http://bio-bigdata.hrbmu.edu.cn/cling

http://bio-bigdata.hrbmu.edu.cn/lncSubpathway

http://bio-bigdata.hrbmu.edu.cn/diseasemeth

http://bio-bigdata.hrbmu.edu.cn/ncRI

http://bio-bigdata.hrbmu.edu.cn/ncDR

http://bio-bigdata.hrbmu.edu.cn/nsdna

http://bio-bigdata.hrbmu.edu.cn/cardio_ncrna

http://bio-bigdata.hrbmu.edu.cn/mirTarPri

http://bio-bigdata.hrbmu.edu.cn/IntNetLncSim

http://bio-bigdata.hrbmu.edu.cn/esnpo

http://bio-bigdata.hrbmu.edu.cn/Ubetis-LncDB

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http://bio-bigdata.hrbmu.edu.cn/Psmir

http://bio-bigdata.hrbmu.edu.cn/CHNmiRD

http://bio-bigdata.hrbmu.edu.cn/FAM

http://bio-bigdata.hrbmu.edu.cn/miRSponge

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http://bio-bigdata.hrbmu.edu.cn/LNCmap/

http://bio-bigdata.hrbmu.edu.cn/CHG

http://bio-bigdata.hrbmu.edu.cn/LncMod

http://bio-bigdata.hrbmu.edu.cn/lnc2cancer

http://bio-bigdata.hrbmu.edu.cn/Co-LncRNA

http://bio-bigdata.hrbmu.edu.cn/lncrnaontology

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http://www.bio-bigdata.net/SubpathwayMiner/

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